| 隨著土傳病害，土壤鹽漬化等問題的日益嚴重，因此，改善改善施肥結構、改進施肥方式，合理使用化肥、提高化肥利用率尤為重要。
1、針對土壤特性選擇肥料。中國各地區的土壤類型差異很大，南方地區的紅壤、磚紅壤、黃壤、黃棕壤、棕壤呈酸性或微酸性，施用磷肥宜用偏堿性的鈣鎂磷肥；北方土壤黑鈣土、栗鈣土、灰鈣土、褐土等多呈堿性，施用磷肥宜用偏酸性的過磷酸鈣；連續施肥多年的大棚、老菜田一般呈逐步酸化趨勢，且鈣鎂元素缺乏，磷肥宜選用偏堿性的鈣鎂磷肥、磷礦粉等，既可調節土壤酸度，又可供應鈣鎂元素；有鹽漬化特征的堿土、鹽土，尤其是濱海鹽土，可以施用磷石膏，施用鉀肥宜選用硫酸鉀。
2、針對植物營養特性選擇肥料。植物種類、品種不同對養分需求不同，同一植物品種不同生育期、不同產量水平對養分需求數量和比例不同；不同植物對養分種類有特殊反應；不同植物對養分吸收利用能力也有差異，選擇化肥品種應根據作物營養特點來科學選擇。據研究，銨態氮肥與硝態氮肥對蔬菜硝酸鹽含量的影響沒有顯著差異，一般蔬菜是喜硝態氮的作物，氮肥宜選用硝酸銨、硝酸鈣等；鱗莖類蔬菜對硫肥，可以選用含硫較多的肥料，如過磷酸鈣、硫酸鎂、硫酸鉀等；十字花科的蔬菜對硼肥比較敏感，宜選用含硼較多的硼酸、硼砂等；鮮食性的瓜菜如西瓜、甜瓜以及茶葉等對氯毒害敏感，一般不宜選用氯化銨、氯化鉀等等含氯化肥；大白菜、番茄等易出現缺鈣癥狀（干燒心、蒂腐病等），宜用含有效鈣較多的過磷酸鈣和硝酸鈣；水果、茶葉則需要大量的有機肥。
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